表达差异图
大家好，欢迎来到小洋专栏！不知道上期。GO|KEGG你怎么学圆图？本期，小洋将向大家介绍如何利用仙桃学术工具绘制差异图。
基本概念
表达差异图(非配对):用于绘制疾病组和对照组分子的表达差异。
表达差异配对图：一种可视化配对样本的方法。配对样本可以有效地控制其他混合因素。有几种类型的配对：
① 前后配对；
② 同一受试对象，配对两个不同部位；
③ 条件配对：根据同一特征，如同一年龄、同一性别的患者配对 1 ；
④ 配对相同样本的两种检测方法。
统计方法：
T test,?亦称 student t 检验（Student's t test），主要用于两组之间的比较，两组需要满足正态性的要求。
配对样本 T 检验：参数检测方法用于检测配对类型。适用条件：连续变量、配对关系、差值服从或近似服从正态。
Weltch`t test,?也称为不等方差检查，即当两组只满足正态而不满足方差齐度的要求时，可以选择用这种方法对两组进行比较。
Wilcoxon rank sum test,也叫 Mann-Whitney U test（曼-惠特尼 U 检查)，或 Wilcoxon-Mann-Whitney test。秩和检验是一种假设检验方法，一般用于两组不符合正态性的情况。
Wilcoxon signed rank test：对配对类型的非参数检验方法采用符号秩和检验，对配对样本不满意T 检验研究不符合正态性！
应用场景
非匹配样本是基于云数据表达差异图的云版本。选择云输入 1 或多个分子，完成非匹配样本的分组比较。可视化类型包括常见的 点图、箱图、柱图、小提琴图等。
配对图可以分析和可视化配对类型的数据，同时显示同一配对组多个分子的表达！
主要结果
非配对图
柱状图：常见的分组比较图之一，柱状图的高度一般代表每组的平均值，并附有误差线，表示组中的变化程度。（左边是二维分组比较，右边是一维分组比较）。
箱式图：常见的分组比较图之一常见的分组比较图之一中位数，盒子上下代表上四分位(75 百分位数)和下四分位(25 百分位数)。
一般来说，如果分组中没有离群值，如果箱子的上下线(Q1-1.5*IQR or Q3 1.5*IQR,下四分位-1.5 倍四分位距)，线的最远位置为最小值或最大值。
盒子上下点代表离群值的点。(左侧为二维分组比较，右侧为一维分组比较)
点图：表示组中所有值点的位置，并添加误差线来表示组中的变化。点图可以直接看到组中各种样本的组。（左边是二维组比较，右边是一维组比较）。
小提琴图：形状与小提琴相似。在同一水平线上分布的样品越多，样品就越宽，否则就越窄。小提琴图可以有效地显示分组中样品的分布。（左边是二维分组比较，右边是一维分组比较）。
配对图
左侧为配对样本 1 指标，右侧为配对样本多指标
每个连接代表一个配对样本
一般线的趋势方向越一致，越倾斜，两组的差异就越明显。如果线的趋势不明显，则可以通过添加箱图来添加整体中位数，这可能会更直观地显示两组之间的差异。具体情况需要检查统计描述和统计检查结果。
最多一张图 10 分子，更多分子建议分成两张图！
以上是表达差异图的背景介绍。如果想进一步掌握表达差异的相关内容，也可以登录解螺旋官网深入学习探索！
实战演练
让我们来看看2021年6月发表的一篇文章。Frontiers in Genetics”（IF= 4.06）杂志上的一篇文章。Upregulation of LIMK1 Is Correlated With Poor Prognosis and Immune Infiltrates in Lung Adenocarcinoma”。
期刊简介
使用工具
仙桃学术（https://www.xiantao.love）
图形复现? ??
非配对图
?复现过程?点击【生信工具】进入仙桃学术
→ 立即使用
表达差异(挑)→ (云非配对样本)→【组合图】→ 输入分子LIMK1
?点击确认：
保存结果：
配对图
?复现过程?表达差异(挑)→ (云配对样本)→输入分子LIMK1
保存结果：
好了，这里介绍一下本期表达差异图的相关内容，希望对大家的科研工作有所帮助。我是小洋。~
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